注冊制股票和普通股票的區別在于：理念不同、效果不同以及具體操作不同。中國發行的普通股票具體為核準制股票，不同于注冊制股票的地方可看作是核準制與注冊制的區別。核準制，指發行人申請發行證券，不僅要公開披露與發行證券有關的信息，還必須符合法律所規定的發行條件。

1、二者理念不同

注冊制和核準制作為兩種不同的證券發行監管制度，反映了不同的政府監管理念，實質就是政府在證券發行過程中到底應該扮演什么樣的角色、發揮怎樣的作用。在核準制看來，無論是證券發行者還是投資人都是有優劣之分的，不是所有人都有能力做出準確判斷，因此需要政府進行裁決；而在注冊制的支持者看來，在既定的制度下，只要個人和企業都具有完全的信息，也具有完全的理性，個人追求效用最大化，企業追求利潤最大化，各種稀缺的資源在競爭中可以達到均衡狀態。但無論是個人還是企業的理性同時也都是有限的，有限理性意味著沒有人能夠預見競爭市場中誰優誰劣，也就是說，在市場中證券的發行人與投資者處于平等對稱的位置，沒有人有資格對其優劣做出評判，包括政府。注冊制下，政府不通過對證券質量的審查來決定是否批準證券發行，而是要求證券發行人提供全面的信息，由投資者自己來判斷證券發行人及其發行的證券是否具有投資價值。這種理念充分尊重市場經濟的自由、市場主體行為的自主、監管部門的規范與效率。
2、二者效果不同

注冊制與核準制各有優劣，這也是二者長期并存的根源。注冊制的優點在于：對證券發行者而言，所有有發行證券意愿的公司可以公平地獲得發行證券的機會；對證券監管部門而言，形式審查縮短了證券審核和發行的時間，提高了監管部門的效率，降低了制度運行成本；對投資者而言，把證券的發行交由市場來選擇有助于市場機制的培育和成熟，培養和提高投資者接受信息能力和理性投資能力，投資者的成熟理性是證券市場理性的根本所在。
3、二者具體操作不同

由于理念不同、特征不同，注冊制與核準制在法律基礎、市場結構、監管方式、審核機構、審核內容等方面都有所區別。